Di tingkat internasional, ia mewakili Sudan Selatan. Ia bermain terutama sebagai Bek.

Sepanjang Kualifikasi Kejuaraan Dunia, Afrika 2026, Athir Thomas Magor Abdo Gaber tampil dalam 6 pertandingan, dengan rata-rata 0 tekel, 0 intersepsi, dan 0 sapuan per pertandingan, serta memblokir 0 tembakan per pertandingan.