Saat ini ia bermain untuk APR FC, mengenakan kaus bernomor 3. Di tingkat internasional, ia mewakili Rwanda. Ia bermain terutama sebagai Bek.

Sepanjang Kualifikasi Kejuaraan Dunia, Afrika 2026, Claude Niyomugabo tampil dalam 10 pertandingan, dengan rata-rata 0.2 tekel, 0 intersepsi, dan 0.7 sapuan per pertandingan, serta memblokir 0 tembakan per pertandingan.