Saat ini ia bermain untuk Atletico Morelia, mengenakan kaus bernomor 28. Ia bermain terutama sebagai Penyerang. Tinggi badannya 180 cm dan berat badannya 80 kg.

Pada musim Meksiko Ascenso MX 2025-2026, José Flores mencetak 6 gol dan memberikan 0 assist dalam 11 penampilan, dengan rata-rata 0.5 gol per pertandingan dari 0 percobaan tembakan dan 0 tepat sasaran.