वे वर्तमान में एफके ज़ाल्गिरिस विलनियस के लिए खेलते हैं और नंबर 14 की जर्सी पहनते हैं। वे मुख्य रूप से डिफेंडर के रूप में खेलते हैं।

यूईएफए यूथ लीग 2024-2025 के दौरान, Martynas Šetkus ने 2 मैचों में खेला, प्रति मैच औसतन 5.5 टैकल, 1.5 इंटरसेप्शन, और 1.5 क्लीयरेंस किए, साथ ही प्रति मैच 0 शॉट ब्लॉक किए।