Di tingkat internasional, ia mewakili Qatar U17. Ia bermain terutama sebagai Bek.

Sepanjang Piala Negara-negara Teluk U17 2025, Mostafa Khalid Ahmed tampil dalam 3 pertandingan, dengan rata-rata 0.7 tekel, 0.7 intersepsi, dan 4.7 sapuan per pertandingan, serta memblokir 0.7 tembakan per pertandingan.